コンビニのセイコーマート（セコマ）で使えるコード決済は、以下の通りです。
（2019年10月1日現在）
・PayPay（ペイペイ）
・LINE Pay（ラインペイ）
・楽天ペイ
・Origami Pay（オリガミペイ）
・au PAY（エーユーペイ）
セイコーマート独自の電子マネーである「Pecoma（ペコマ）」のスマホ決済（セイコーマートアプリ）も利用できます。ペコマは、セイコーマートの電子マネー機能付き会員カードで、クラブポイントを貯めたり使ったりもできます。
対応していないコード決済は、 d払い （コード決済） 、メルペイ（コード決済）、 ゆうちょPay（銀行Pay）、Bank Pay（バンクペイ）、J-Coin Pay（ジェイコインペイ）、クオカードPay、FamiPay（ファミペイ）、アリペイ、ウィーチャットペイ 、ネイバーペイなどです。
コンビニ各社 10月からのポイント還元・割引キャンペーンまとめ［キャッシュレス・ポイント還元事業］
クレジットカード・電子マネー
セイコーマートでは、主要なクレジットカード（VISA・MasterCard・JCB・AMEX・Diners）が使えます。
一部の店舗では、銀聯カードも使えます。
主要な電子マネー（交通系電子マネー、楽天Edy、WAON、iD、QUICPay）が使えます。nanacoは使えません。
札幌市内の店舗では、SAPICAも使えます。
※メルペイ（iD決済）・d払い（iD）は使えます。
消費税の軽減税率への対応
セイコーマートでは、日用品・酒類・雑誌などでは消費税率10％の標準税率が、飲食料品（持ち帰りに限る）は消費税率8％の軽減税率が適用されます。
※飲食料品を店内のイートインスペースで飲食する場合には、消費税率10％の標準税率が適用されます（レジで申し出てください）。
「キャッシュレス・ポイント還元事業（消費者還元事業）」は、2％還元の対象となります（決済時即時還元）。